Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Afg3l1Q920A7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Afg3l1Q920A7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Afg3l1Q920A7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Afg3l1Q920A7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Afg3l1Q920A7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Afg3l1Q920A7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Afg3l1Q920A7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Afg3l1Q920A7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Afg3l1Q920A7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Afg3l1Q920A7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Afg3l1Q920A7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Afg3l1Q920A7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Afg3l1Q920A7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Afg3l1Q920A7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Afg3l1Q920A7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Afg3l1Q920A7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Afg3l1Q920A7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Afg3l1Q920A7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Afg3l1Q920A7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Afg3l1Q920A7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Afg3l1Q920A7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Afg3l1Q920A7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Afg3l1Q920A7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Afg3l1Q920A7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Afg3l1Q920A7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Afg3l1Q920A7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Afg3l1Q920A7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Afg3l1Q920A7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Afg3l1Q920A7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Afg3l1Q920A7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Afg3l1Q920A7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Afg3l1Q920A7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Afg3l1Q920A7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Afg3l1Q920A7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Afg3l1Q920A7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Afg3l1Q920A7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Afg3l1Q920A7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Afg3l1Q920A7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Afg3l1Q920A7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Afg3l1Q920A7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Afg3l1Q920A7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Afg3l1Q920A7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Afg3l1Q920A7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Afg3l1Q920A7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Afg3l1Q920A7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Afg3l1Q920A7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Afg3l1Q920A7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Afg3l1Q920A7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Afg3l1Q920A7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Afg3l1Q920A7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Afg3l1Q920A7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Afg3l1Q920A7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Afg3l1Q920A7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Afg3l1Q920A7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Afg3l1Q920A7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Afg3l1Q920A7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Afg3l1Q920A7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Afg3l1Q920A7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Afg3l1Q920A7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Afg3l1Q920A7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Afg3l1Q920A7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Afg3l1Q920A7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Afg3l1Q920A7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Afg3l1Q920A7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Afg3l1Q920A7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Afg3l1Q920A7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Afg3l1Q920A7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Afg3l1Q920A7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Afg3l1Q920A7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Afg3l1Q920A7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Afg3l1Q920A7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Afg3l1Q920A7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Afg3l1Q920A7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Afg3l1Q920A7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Afg3l1Q920A7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Afg3l1Q920A7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Afg3l1Q920A7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Afg3l1Q920A7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Afg3l1Q920A7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Afg3l1Q920A7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Afg3l1Q920A7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Afg3l1Q920A7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Afg3l1Q920A7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Afg3l1Q920A7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Afg3l1Q920A7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Afg3l1Q920A7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Afg3l1Q920A7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Afg3l1Q920A7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Afg3l1Q920A7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Afg3l1Q920A7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Afg3l1Q920A7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Afg3l1Q920A7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Afg3l1Q920A7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Afg3l1Q920A7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Afg3l1Q920A7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Afg3l1Q920A7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Afg3l1Q920A7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Afg3l1Q920A7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Afg3l1Q920A7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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