Protein–RNA interactions for Protein: Q91YI1

Atg13, Autophagy-related protein 13, mousemouse

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg13Q91YI1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
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Atg13Q91YI1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg13Q91YI1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg13Q91YI1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg13Q91YI1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg13Q91YI1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg13Q91YI1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg13Q91YI1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg13Q91YI1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg13Q91YI1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg13Q91YI1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg13Q91YI1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg13Q91YI1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg13Q91YI1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg13Q91YI1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg13Q91YI1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg13Q91YI1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg13Q91YI1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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Atg13Q91YI1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg13Q91YI1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
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Atg13Q91YI1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg13Q91YI1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg13Q91YI1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg13Q91YI1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg13Q91YI1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
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Atg13Q91YI1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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Atg13Q91YI1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg13Q91YI1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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Atg13Q91YI1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg13Q91YI1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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Atg13Q91YI1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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Atg13Q91YI1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg13Q91YI1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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Atg13Q91YI1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg13Q91YI1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg13Q91YI1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg13Q91YI1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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Atg13Q91YI1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Atg13Q91YI1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Atg13Q91YI1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg13Q91YI1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg13Q91YI1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg13Q91YI1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg13Q91YI1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg13Q91YI1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg13Q91YI1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg13Q91YI1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg13Q91YI1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg13Q91YI1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg13Q91YI1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg13Q91YI1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg13Q91YI1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg13Q91YI1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg13Q91YI1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg13Q91YI1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg13Q91YI1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg13Q91YI1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg13Q91YI1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg13Q91YI1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg13Q91YI1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg13Q91YI1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg13Q91YI1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg13Q91YI1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg13Q91YI1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg13Q91YI1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms