Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN6

Txnl1, Thioredoxin-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txnl1Q8CDN6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Txnl1Q8CDN6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Txnl1Q8CDN6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Txnl1Q8CDN6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Txnl1Q8CDN6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Txnl1Q8CDN6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Txnl1Q8CDN6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Txnl1Q8CDN6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Txnl1Q8CDN6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Txnl1Q8CDN6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Txnl1Q8CDN6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Txnl1Q8CDN6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Txnl1Q8CDN6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Txnl1Q8CDN6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Txnl1Q8CDN6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Txnl1Q8CDN6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Txnl1Q8CDN6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Txnl1Q8CDN6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Txnl1Q8CDN6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Txnl1Q8CDN6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Txnl1Q8CDN6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Txnl1Q8CDN6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Txnl1Q8CDN6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Txnl1Q8CDN6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Txnl1Q8CDN6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Txnl1Q8CDN6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Txnl1Q8CDN6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Txnl1Q8CDN6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Txnl1Q8CDN6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Txnl1Q8CDN6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Txnl1Q8CDN6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Txnl1Q8CDN6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Txnl1Q8CDN6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Txnl1Q8CDN6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Txnl1Q8CDN6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Txnl1Q8CDN6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Txnl1Q8CDN6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Txnl1Q8CDN6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Txnl1Q8CDN6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Txnl1Q8CDN6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Txnl1Q8CDN6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Txnl1Q8CDN6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Txnl1Q8CDN6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Txnl1Q8CDN6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Txnl1Q8CDN6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Txnl1Q8CDN6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Txnl1Q8CDN6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Txnl1Q8CDN6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Txnl1Q8CDN6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Txnl1Q8CDN6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Txnl1Q8CDN6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Txnl1Q8CDN6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Txnl1Q8CDN6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Txnl1Q8CDN6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Txnl1Q8CDN6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Txnl1Q8CDN6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Txnl1Q8CDN6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Txnl1Q8CDN6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Txnl1Q8CDN6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Txnl1Q8CDN6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Txnl1Q8CDN6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Txnl1Q8CDN6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Txnl1Q8CDN6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Txnl1Q8CDN6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Txnl1Q8CDN6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Txnl1Q8CDN6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Txnl1Q8CDN6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Txnl1Q8CDN6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Txnl1Q8CDN6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Txnl1Q8CDN6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Txnl1Q8CDN6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Txnl1Q8CDN6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Txnl1Q8CDN6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Txnl1Q8CDN6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Txnl1Q8CDN6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Txnl1Q8CDN6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Txnl1Q8CDN6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Txnl1Q8CDN6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Txnl1Q8CDN6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Txnl1Q8CDN6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Txnl1Q8CDN6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Txnl1Q8CDN6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Txnl1Q8CDN6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Txnl1Q8CDN6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Txnl1Q8CDN6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Txnl1Q8CDN6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Txnl1Q8CDN6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Txnl1Q8CDN6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Txnl1Q8CDN6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Txnl1Q8CDN6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Txnl1Q8CDN6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Txnl1Q8CDN6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Txnl1Q8CDN6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Txnl1Q8CDN6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Txnl1Q8CDN6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Txnl1Q8CDN6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Txnl1Q8CDN6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Txnl1Q8CDN6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Txnl1Q8CDN6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Txnl1Q8CDN6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms