Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pggt1bQ8BUY9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pggt1bQ8BUY9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pggt1bQ8BUY9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pggt1bQ8BUY9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pggt1bQ8BUY9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pggt1bQ8BUY9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pggt1bQ8BUY9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Pggt1bQ8BUY9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pggt1bQ8BUY9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pggt1bQ8BUY9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pggt1bQ8BUY9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Pggt1bQ8BUY9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pggt1bQ8BUY9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pggt1bQ8BUY9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pggt1bQ8BUY9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Pggt1bQ8BUY9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pggt1bQ8BUY9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pggt1bQ8BUY9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pggt1bQ8BUY9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pggt1bQ8BUY9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Pggt1bQ8BUY9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pggt1bQ8BUY9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pggt1bQ8BUY9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pggt1bQ8BUY9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pggt1bQ8BUY9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pggt1bQ8BUY9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pggt1bQ8BUY9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pggt1bQ8BUY9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pggt1bQ8BUY9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pggt1bQ8BUY9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pggt1bQ8BUY9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pggt1bQ8BUY9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pggt1bQ8BUY9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pggt1bQ8BUY9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pggt1bQ8BUY9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pggt1bQ8BUY9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pggt1bQ8BUY9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pggt1bQ8BUY9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pggt1bQ8BUY9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pggt1bQ8BUY9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pggt1bQ8BUY9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pggt1bQ8BUY9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pggt1bQ8BUY9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pggt1bQ8BUY9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pggt1bQ8BUY9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pggt1bQ8BUY9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pggt1bQ8BUY9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pggt1bQ8BUY9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pggt1bQ8BUY9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pggt1bQ8BUY9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pggt1bQ8BUY9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pggt1bQ8BUY9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pggt1bQ8BUY9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pggt1bQ8BUY9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pggt1bQ8BUY9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pggt1bQ8BUY9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pggt1bQ8BUY9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pggt1bQ8BUY9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pggt1bQ8BUY9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pggt1bQ8BUY9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pggt1bQ8BUY9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pggt1bQ8BUY9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pggt1bQ8BUY9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pggt1bQ8BUY9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pggt1bQ8BUY9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pggt1bQ8BUY9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pggt1bQ8BUY9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Pggt1bQ8BUY9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pggt1bQ8BUY9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Pggt1bQ8BUY9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pggt1bQ8BUY9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pggt1bQ8BUY9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pggt1bQ8BUY9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pggt1bQ8BUY9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Pggt1bQ8BUY9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pggt1bQ8BUY9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pggt1bQ8BUY9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pggt1bQ8BUY9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pggt1bQ8BUY9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pggt1bQ8BUY9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pggt1bQ8BUY9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pggt1bQ8BUY9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pggt1bQ8BUY9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pggt1bQ8BUY9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pggt1bQ8BUY9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms