Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG40

Katnb1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnb1Q8BG40 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms