Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTN6

STRADA, STE20-related kinase adapter protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADAQ7RTN6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRADAQ7RTN6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRADAQ7RTN6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRADAQ7RTN6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
STRADAQ7RTN6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRADAQ7RTN6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRADAQ7RTN6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRADAQ7RTN6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRADAQ7RTN6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRADAQ7RTN6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRADAQ7RTN6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRADAQ7RTN6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRADAQ7RTN6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRADAQ7RTN6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRADAQ7RTN6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRADAQ7RTN6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRADAQ7RTN6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRADAQ7RTN6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRADAQ7RTN6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRADAQ7RTN6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRADAQ7RTN6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRADAQ7RTN6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRADAQ7RTN6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRADAQ7RTN6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRADAQ7RTN6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRADAQ7RTN6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRADAQ7RTN6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRADAQ7RTN6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRADAQ7RTN6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRADAQ7RTN6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRADAQ7RTN6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRADAQ7RTN6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRADAQ7RTN6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRADAQ7RTN6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRADAQ7RTN6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRADAQ7RTN6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRADAQ7RTN6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRADAQ7RTN6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
STRADAQ7RTN6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRADAQ7RTN6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRADAQ7RTN6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRADAQ7RTN6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRADAQ7RTN6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRADAQ7RTN6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRADAQ7RTN6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRADAQ7RTN6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRADAQ7RTN6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRADAQ7RTN6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRADAQ7RTN6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRADAQ7RTN6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRADAQ7RTN6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRADAQ7RTN6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRADAQ7RTN6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRADAQ7RTN6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRADAQ7RTN6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRADAQ7RTN6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
STRADAQ7RTN6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
STRADAQ7RTN6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
STRADAQ7RTN6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRADAQ7RTN6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms