Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWV7

Rpl35, 60S ribosomal protein L35, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35Q6ZWV7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl35Q6ZWV7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms