Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp8b3Q6UQ17 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp8b3Q6UQ17 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp8b3Q6UQ17 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp8b3Q6UQ17 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp8b3Q6UQ17 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp8b3Q6UQ17 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp8b3Q6UQ17 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp8b3Q6UQ17 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp8b3Q6UQ17 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp8b3Q6UQ17 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp8b3Q6UQ17 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp8b3Q6UQ17 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp8b3Q6UQ17 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp8b3Q6UQ17 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp8b3Q6UQ17 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp8b3Q6UQ17 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp8b3Q6UQ17 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp8b3Q6UQ17 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp8b3Q6UQ17 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp8b3Q6UQ17 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp8b3Q6UQ17 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp8b3Q6UQ17 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp8b3Q6UQ17 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp8b3Q6UQ17 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp8b3Q6UQ17 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp8b3Q6UQ17 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp8b3Q6UQ17 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp8b3Q6UQ17 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp8b3Q6UQ17 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp8b3Q6UQ17 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp8b3Q6UQ17 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp8b3Q6UQ17 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp8b3Q6UQ17 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp8b3Q6UQ17 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp8b3Q6UQ17 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp8b3Q6UQ17 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp8b3Q6UQ17 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp8b3Q6UQ17 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp8b3Q6UQ17 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp8b3Q6UQ17 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp8b3Q6UQ17 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp8b3Q6UQ17 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp8b3Q6UQ17 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp8b3Q6UQ17 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp8b3Q6UQ17 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp8b3Q6UQ17 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp8b3Q6UQ17 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp8b3Q6UQ17 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp8b3Q6UQ17 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp8b3Q6UQ17 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp8b3Q6UQ17 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp8b3Q6UQ17 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp8b3Q6UQ17 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp8b3Q6UQ17 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp8b3Q6UQ17 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp8b3Q6UQ17 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp8b3Q6UQ17 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp8b3Q6UQ17 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp8b3Q6UQ17 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp8b3Q6UQ17 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp8b3Q6UQ17 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp8b3Q6UQ17 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp8b3Q6UQ17 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp8b3Q6UQ17 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp8b3Q6UQ17 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp8b3Q6UQ17 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp8b3Q6UQ17 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp8b3Q6UQ17 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp8b3Q6UQ17 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp8b3Q6UQ17 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp8b3Q6UQ17 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp8b3Q6UQ17 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp8b3Q6UQ17 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp8b3Q6UQ17 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp8b3Q6UQ17 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp8b3Q6UQ17 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp8b3Q6UQ17 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp8b3Q6UQ17 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp8b3Q6UQ17 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp8b3Q6UQ17 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp8b3Q6UQ17 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp8b3Q6UQ17 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp8b3Q6UQ17 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp8b3Q6UQ17 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp8b3Q6UQ17 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp8b3Q6UQ17 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp8b3Q6UQ17 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp8b3Q6UQ17 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp8b3Q6UQ17 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp8b3Q6UQ17 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp8b3Q6UQ17 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp8b3Q6UQ17 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp8b3Q6UQ17 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp8b3Q6UQ17 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp8b3Q6UQ17 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp8b3Q6UQ17 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp8b3Q6UQ17 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp8b3Q6UQ17 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp8b3Q6UQ17 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms