Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDG5

Smarcc2, SWI/SNF complex subunit SMARCC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc2Q6PDG5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smarcc2Q6PDG5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smarcc2Q6PDG5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smarcc2Q6PDG5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smarcc2Q6PDG5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smarcc2Q6PDG5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smarcc2Q6PDG5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smarcc2Q6PDG5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smarcc2Q6PDG5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smarcc2Q6PDG5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smarcc2Q6PDG5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Smarcc2Q6PDG5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smarcc2Q6PDG5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smarcc2Q6PDG5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smarcc2Q6PDG5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarcc2Q6PDG5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarcc2Q6PDG5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarcc2Q6PDG5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarcc2Q6PDG5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarcc2Q6PDG5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarcc2Q6PDG5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarcc2Q6PDG5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarcc2Q6PDG5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarcc2Q6PDG5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarcc2Q6PDG5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarcc2Q6PDG5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarcc2Q6PDG5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarcc2Q6PDG5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarcc2Q6PDG5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarcc2Q6PDG5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarcc2Q6PDG5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarcc2Q6PDG5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarcc2Q6PDG5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarcc2Q6PDG5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarcc2Q6PDG5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarcc2Q6PDG5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarcc2Q6PDG5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarcc2Q6PDG5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarcc2Q6PDG5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarcc2Q6PDG5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarcc2Q6PDG5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarcc2Q6PDG5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarcc2Q6PDG5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarcc2Q6PDG5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarcc2Q6PDG5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarcc2Q6PDG5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarcc2Q6PDG5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarcc2Q6PDG5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarcc2Q6PDG5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarcc2Q6PDG5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarcc2Q6PDG5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarcc2Q6PDG5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarcc2Q6PDG5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarcc2Q6PDG5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarcc2Q6PDG5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarcc2Q6PDG5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarcc2Q6PDG5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarcc2Q6PDG5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarcc2Q6PDG5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarcc2Q6PDG5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarcc2Q6PDG5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarcc2Q6PDG5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarcc2Q6PDG5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarcc2Q6PDG5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarcc2Q6PDG5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarcc2Q6PDG5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Smarcc2Q6PDG5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarcc2Q6PDG5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarcc2Q6PDG5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarcc2Q6PDG5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarcc2Q6PDG5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarcc2Q6PDG5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarcc2Q6PDG5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarcc2Q6PDG5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarcc2Q6PDG5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarcc2Q6PDG5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarcc2Q6PDG5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarcc2Q6PDG5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarcc2Q6PDG5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarcc2Q6PDG5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarcc2Q6PDG5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarcc2Q6PDG5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarcc2Q6PDG5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarcc2Q6PDG5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarcc2Q6PDG5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarcc2Q6PDG5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarcc2Q6PDG5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarcc2Q6PDG5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarcc2Q6PDG5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarcc2Q6PDG5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarcc2Q6PDG5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarcc2Q6PDG5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarcc2Q6PDG5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarcc2Q6PDG5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarcc2Q6PDG5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarcc2Q6PDG5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarcc2Q6PDG5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarcc2Q6PDG5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarcc2Q6PDG5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarcc2Q6PDG5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms