Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y9

Podnl1, Podocan-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podnl1Q6P3Y9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Podnl1Q6P3Y9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Podnl1Q6P3Y9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Podnl1Q6P3Y9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Podnl1Q6P3Y9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Podnl1Q6P3Y9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Podnl1Q6P3Y9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Podnl1Q6P3Y9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Podnl1Q6P3Y9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Podnl1Q6P3Y9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Podnl1Q6P3Y9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Podnl1Q6P3Y9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Podnl1Q6P3Y9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Podnl1Q6P3Y9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Podnl1Q6P3Y9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Podnl1Q6P3Y9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Podnl1Q6P3Y9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Podnl1Q6P3Y9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Podnl1Q6P3Y9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Podnl1Q6P3Y9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Podnl1Q6P3Y9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Podnl1Q6P3Y9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Podnl1Q6P3Y9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Podnl1Q6P3Y9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Podnl1Q6P3Y9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Podnl1Q6P3Y9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Podnl1Q6P3Y9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Podnl1Q6P3Y9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Podnl1Q6P3Y9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Podnl1Q6P3Y9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Podnl1Q6P3Y9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Podnl1Q6P3Y9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Podnl1Q6P3Y9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Podnl1Q6P3Y9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Podnl1Q6P3Y9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Podnl1Q6P3Y9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Podnl1Q6P3Y9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Podnl1Q6P3Y9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Podnl1Q6P3Y9 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Podnl1Q6P3Y9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Podnl1Q6P3Y9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Podnl1Q6P3Y9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Podnl1Q6P3Y9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Podnl1Q6P3Y9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Podnl1Q6P3Y9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Podnl1Q6P3Y9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Podnl1Q6P3Y9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Podnl1Q6P3Y9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Podnl1Q6P3Y9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Podnl1Q6P3Y9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Podnl1Q6P3Y9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Podnl1Q6P3Y9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Podnl1Q6P3Y9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Podnl1Q6P3Y9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Podnl1Q6P3Y9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Podnl1Q6P3Y9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Podnl1Q6P3Y9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Podnl1Q6P3Y9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Podnl1Q6P3Y9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Podnl1Q6P3Y9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Podnl1Q6P3Y9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Podnl1Q6P3Y9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Podnl1Q6P3Y9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Podnl1Q6P3Y9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Podnl1Q6P3Y9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Podnl1Q6P3Y9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Podnl1Q6P3Y9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Podnl1Q6P3Y9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Podnl1Q6P3Y9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Podnl1Q6P3Y9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Podnl1Q6P3Y9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Podnl1Q6P3Y9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Podnl1Q6P3Y9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Podnl1Q6P3Y9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Podnl1Q6P3Y9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Podnl1Q6P3Y9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Podnl1Q6P3Y9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Podnl1Q6P3Y9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Podnl1Q6P3Y9 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Podnl1Q6P3Y9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Podnl1Q6P3Y9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Podnl1Q6P3Y9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Podnl1Q6P3Y9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Podnl1Q6P3Y9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Podnl1Q6P3Y9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Podnl1Q6P3Y9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Podnl1Q6P3Y9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Podnl1Q6P3Y9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Podnl1Q6P3Y9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Podnl1Q6P3Y9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Podnl1Q6P3Y9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Podnl1Q6P3Y9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Podnl1Q6P3Y9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Podnl1Q6P3Y9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Podnl1Q6P3Y9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Podnl1Q6P3Y9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Podnl1Q6P3Y9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Podnl1Q6P3Y9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Podnl1Q6P3Y9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Podnl1Q6P3Y9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms