Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW34

NEPRO, Nucleolus and neural progenitor protein, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEPROQ6NW34 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NEPROQ6NW34 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEPROQ6NW34 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEPROQ6NW34 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEPROQ6NW34 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NEPROQ6NW34 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEPROQ6NW34 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEPROQ6NW34 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEPROQ6NW34 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEPROQ6NW34 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEPROQ6NW34 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEPROQ6NW34 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEPROQ6NW34 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEPROQ6NW34 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEPROQ6NW34 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEPROQ6NW34 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEPROQ6NW34 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEPROQ6NW34 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEPROQ6NW34 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NEPROQ6NW34 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEPROQ6NW34 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEPROQ6NW34 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEPROQ6NW34 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEPROQ6NW34 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEPROQ6NW34 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEPROQ6NW34 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEPROQ6NW34 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEPROQ6NW34 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEPROQ6NW34 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEPROQ6NW34 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEPROQ6NW34 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NEPROQ6NW34 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEPROQ6NW34 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NEPROQ6NW34 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEPROQ6NW34 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEPROQ6NW34 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEPROQ6NW34 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEPROQ6NW34 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NEPROQ6NW34 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEPROQ6NW34 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NEPROQ6NW34 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEPROQ6NW34 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEPROQ6NW34 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEPROQ6NW34 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEPROQ6NW34 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEPROQ6NW34 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEPROQ6NW34 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEPROQ6NW34 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEPROQ6NW34 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEPROQ6NW34 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEPROQ6NW34 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEPROQ6NW34 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEPROQ6NW34 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEPROQ6NW34 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEPROQ6NW34 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEPROQ6NW34 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEPROQ6NW34 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEPROQ6NW34 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEPROQ6NW34 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEPROQ6NW34 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEPROQ6NW34 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEPROQ6NW34 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEPROQ6NW34 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEPROQ6NW34 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEPROQ6NW34 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEPROQ6NW34 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEPROQ6NW34 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEPROQ6NW34 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEPROQ6NW34 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEPROQ6NW34 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEPROQ6NW34 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEPROQ6NW34 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEPROQ6NW34 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NEPROQ6NW34 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEPROQ6NW34 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEPROQ6NW34 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEPROQ6NW34 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEPROQ6NW34 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEPROQ6NW34 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEPROQ6NW34 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEPROQ6NW34 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NEPROQ6NW34 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NEPROQ6NW34 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NEPROQ6NW34 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NEPROQ6NW34 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEPROQ6NW34 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEPROQ6NW34 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEPROQ6NW34 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEPROQ6NW34 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NEPROQ6NW34 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEPROQ6NW34 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEPROQ6NW34 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEPROQ6NW34 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NEPROQ6NW34 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEPROQ6NW34 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEPROQ6NW34 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEPROQ6NW34 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEPROQ6NW34 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEPROQ6NW34 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEPROQ6NW34 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms