Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSU2

2810408A11Rik, RIKEN cDNA 2810408A11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2810408A11RikQ6NSU2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
2810408A11RikQ6NSU2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms