Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CltbQ6IRU5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CltbQ6IRU5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CltbQ6IRU5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CltbQ6IRU5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CltbQ6IRU5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CltbQ6IRU5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CltbQ6IRU5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CltbQ6IRU5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CltbQ6IRU5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CltbQ6IRU5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CltbQ6IRU5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CltbQ6IRU5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CltbQ6IRU5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CltbQ6IRU5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CltbQ6IRU5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CltbQ6IRU5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CltbQ6IRU5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CltbQ6IRU5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CltbQ6IRU5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CltbQ6IRU5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CltbQ6IRU5 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CltbQ6IRU5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CltbQ6IRU5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CltbQ6IRU5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CltbQ6IRU5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CltbQ6IRU5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CltbQ6IRU5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CltbQ6IRU5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CltbQ6IRU5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CltbQ6IRU5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CltbQ6IRU5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CltbQ6IRU5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CltbQ6IRU5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CltbQ6IRU5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CltbQ6IRU5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CltbQ6IRU5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CltbQ6IRU5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CltbQ6IRU5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CltbQ6IRU5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CltbQ6IRU5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CltbQ6IRU5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CltbQ6IRU5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CltbQ6IRU5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CltbQ6IRU5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CltbQ6IRU5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CltbQ6IRU5 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CltbQ6IRU5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CltbQ6IRU5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CltbQ6IRU5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CltbQ6IRU5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CltbQ6IRU5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CltbQ6IRU5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CltbQ6IRU5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CltbQ6IRU5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CltbQ6IRU5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CltbQ6IRU5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CltbQ6IRU5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CltbQ6IRU5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CltbQ6IRU5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CltbQ6IRU5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CltbQ6IRU5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CltbQ6IRU5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CltbQ6IRU5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CltbQ6IRU5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CltbQ6IRU5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CltbQ6IRU5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CltbQ6IRU5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CltbQ6IRU5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CltbQ6IRU5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CltbQ6IRU5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CltbQ6IRU5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CltbQ6IRU5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CltbQ6IRU5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CltbQ6IRU5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CltbQ6IRU5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CltbQ6IRU5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CltbQ6IRU5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CltbQ6IRU5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CltbQ6IRU5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CltbQ6IRU5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CltbQ6IRU5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CltbQ6IRU5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CltbQ6IRU5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CltbQ6IRU5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CltbQ6IRU5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CltbQ6IRU5 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CltbQ6IRU5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CltbQ6IRU5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CltbQ6IRU5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CltbQ6IRU5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CltbQ6IRU5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CltbQ6IRU5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CltbQ6IRU5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CltbQ6IRU5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CltbQ6IRU5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CltbQ6IRU5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CltbQ6IRU5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CltbQ6IRU5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CltbQ6IRU5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms