Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkp4Q68FH0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkp4Q68FH0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkp4Q68FH0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkp4Q68FH0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkp4Q68FH0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkp4Q68FH0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkp4Q68FH0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkp4Q68FH0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkp4Q68FH0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkp4Q68FH0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkp4Q68FH0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkp4Q68FH0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkp4Q68FH0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkp4Q68FH0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkp4Q68FH0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkp4Q68FH0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkp4Q68FH0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkp4Q68FH0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkp4Q68FH0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkp4Q68FH0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkp4Q68FH0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkp4Q68FH0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkp4Q68FH0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkp4Q68FH0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkp4Q68FH0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkp4Q68FH0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkp4Q68FH0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkp4Q68FH0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkp4Q68FH0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkp4Q68FH0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkp4Q68FH0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkp4Q68FH0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkp4Q68FH0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkp4Q68FH0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkp4Q68FH0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkp4Q68FH0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkp4Q68FH0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkp4Q68FH0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkp4Q68FH0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkp4Q68FH0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkp4Q68FH0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkp4Q68FH0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkp4Q68FH0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkp4Q68FH0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkp4Q68FH0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkp4Q68FH0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkp4Q68FH0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkp4Q68FH0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkp4Q68FH0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkp4Q68FH0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkp4Q68FH0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkp4Q68FH0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkp4Q68FH0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkp4Q68FH0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkp4Q68FH0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkp4Q68FH0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkp4Q68FH0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkp4Q68FH0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkp4Q68FH0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkp4Q68FH0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkp4Q68FH0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkp4Q68FH0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkp4Q68FH0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkp4Q68FH0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkp4Q68FH0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkp4Q68FH0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkp4Q68FH0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkp4Q68FH0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkp4Q68FH0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkp4Q68FH0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkp4Q68FH0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkp4Q68FH0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms