Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc8eQ66JT1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc8eQ66JT1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc8eQ66JT1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc8eQ66JT1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc8eQ66JT1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc8eQ66JT1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc8eQ66JT1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc8eQ66JT1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc8eQ66JT1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc8eQ66JT1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc8eQ66JT1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc8eQ66JT1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc8eQ66JT1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc8eQ66JT1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc8eQ66JT1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc8eQ66JT1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc8eQ66JT1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc8eQ66JT1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc8eQ66JT1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc8eQ66JT1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc8eQ66JT1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc8eQ66JT1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc8eQ66JT1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc8eQ66JT1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc8eQ66JT1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc8eQ66JT1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc8eQ66JT1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrc8eQ66JT1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrc8eQ66JT1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrc8eQ66JT1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrc8eQ66JT1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrc8eQ66JT1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrc8eQ66JT1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrc8eQ66JT1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrc8eQ66JT1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrc8eQ66JT1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrc8eQ66JT1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrc8eQ66JT1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrc8eQ66JT1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrc8eQ66JT1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrc8eQ66JT1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrc8eQ66JT1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrc8eQ66JT1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrc8eQ66JT1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrc8eQ66JT1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrc8eQ66JT1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrc8eQ66JT1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrc8eQ66JT1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrc8eQ66JT1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrc8eQ66JT1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrc8eQ66JT1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrc8eQ66JT1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrc8eQ66JT1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrc8eQ66JT1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrc8eQ66JT1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrc8eQ66JT1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrc8eQ66JT1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrc8eQ66JT1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrc8eQ66JT1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrc8eQ66JT1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrc8eQ66JT1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrc8eQ66JT1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrc8eQ66JT1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrc8eQ66JT1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrc8eQ66JT1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Lrrc8eQ66JT1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Lrrc8eQ66JT1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Lrrc8eQ66JT1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms