Protein–RNA interactions for Protein: Q62468

Vil1, Villin-1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vil1Q62468 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Vil1Q62468 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vil1Q62468 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vil1Q62468 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vil1Q62468 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vil1Q62468 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vil1Q62468 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vil1Q62468 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Vil1Q62468 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vil1Q62468 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vil1Q62468 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vil1Q62468 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vil1Q62468 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vil1Q62468 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vil1Q62468 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vil1Q62468 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vil1Q62468 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vil1Q62468 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Vil1Q62468 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vil1Q62468 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vil1Q62468 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vil1Q62468 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vil1Q62468 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vil1Q62468 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vil1Q62468 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vil1Q62468 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vil1Q62468 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vil1Q62468 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vil1Q62468 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Vil1Q62468 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vil1Q62468 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vil1Q62468 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vil1Q62468 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vil1Q62468 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vil1Q62468 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vil1Q62468 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vil1Q62468 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Vil1Q62468 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Vil1Q62468 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Vil1Q62468 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vil1Q62468 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vil1Q62468 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vil1Q62468 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vil1Q62468 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vil1Q62468 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vil1Q62468 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vil1Q62468 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vil1Q62468 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vil1Q62468 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vil1Q62468 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vil1Q62468 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vil1Q62468 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vil1Q62468 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vil1Q62468 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vil1Q62468 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vil1Q62468 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vil1Q62468 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vil1Q62468 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vil1Q62468 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vil1Q62468 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vil1Q62468 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vil1Q62468 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vil1Q62468 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vil1Q62468 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vil1Q62468 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Vil1Q62468 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vil1Q62468 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vil1Q62468 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vil1Q62468 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vil1Q62468 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Vil1Q62468 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vil1Q62468 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vil1Q62468 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vil1Q62468 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Vil1Q62468 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vil1Q62468 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vil1Q62468 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vil1Q62468 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vil1Q62468 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vil1Q62468 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vil1Q62468 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vil1Q62468 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vil1Q62468 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vil1Q62468 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Vil1Q62468 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vil1Q62468 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vil1Q62468 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vil1Q62468 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vil1Q62468 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vil1Q62468 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Vil1Q62468 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vil1Q62468 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vil1Q62468 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vil1Q62468 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vil1Q62468 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Vil1Q62468 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vil1Q62468 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vil1Q62468 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vil1Q62468 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Vil1Q62468 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms