Protein–RNA interactions for Protein: Q60864

Stip1, Stress-induced-phosphoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stip1Q60864 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stip1Q60864 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stip1Q60864 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stip1Q60864 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stip1Q60864 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Stip1Q60864 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stip1Q60864 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stip1Q60864 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Stip1Q60864 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Stip1Q60864 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms