Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnot7Q60809 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnot7Q60809 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnot7Q60809 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnot7Q60809 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnot7Q60809 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnot7Q60809 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnot7Q60809 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnot7Q60809 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnot7Q60809 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnot7Q60809 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnot7Q60809 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnot7Q60809 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnot7Q60809 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnot7Q60809 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnot7Q60809 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnot7Q60809 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnot7Q60809 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnot7Q60809 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnot7Q60809 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnot7Q60809 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnot7Q60809 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnot7Q60809 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnot7Q60809 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnot7Q60809 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnot7Q60809 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnot7Q60809 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnot7Q60809 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnot7Q60809 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnot7Q60809 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnot7Q60809 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnot7Q60809 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnot7Q60809 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnot7Q60809 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnot7Q60809 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnot7Q60809 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnot7Q60809 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnot7Q60809 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnot7Q60809 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnot7Q60809 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnot7Q60809 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnot7Q60809 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnot7Q60809 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cnot7Q60809 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnot7Q60809 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnot7Q60809 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnot7Q60809 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnot7Q60809 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnot7Q60809 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnot7Q60809 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnot7Q60809 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnot7Q60809 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnot7Q60809 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnot7Q60809 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnot7Q60809 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnot7Q60809 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnot7Q60809 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnot7Q60809 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnot7Q60809 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnot7Q60809 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnot7Q60809 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnot7Q60809 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnot7Q60809 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnot7Q60809 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnot7Q60809 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnot7Q60809 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnot7Q60809 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnot7Q60809 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnot7Q60809 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnot7Q60809 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnot7Q60809 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnot7Q60809 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnot7Q60809 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnot7Q60809 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnot7Q60809 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnot7Q60809 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnot7Q60809 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnot7Q60809 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnot7Q60809 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnot7Q60809 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnot7Q60809 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnot7Q60809 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnot7Q60809 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnot7Q60809 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnot7Q60809 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnot7Q60809 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnot7Q60809 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnot7Q60809 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnot7Q60809 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnot7Q60809 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnot7Q60809 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnot7Q60809 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnot7Q60809 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnot7Q60809 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnot7Q60809 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnot7Q60809 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnot7Q60809 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnot7Q60809 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnot7Q60809 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnot7Q60809 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms