Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf15Q5UBV8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf15Q5UBV8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf15Q5UBV8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf15Q5UBV8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf15Q5UBV8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf15Q5UBV8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf15Q5UBV8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf15Q5UBV8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf15Q5UBV8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf15Q5UBV8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf15Q5UBV8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf15Q5UBV8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf15Q5UBV8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf15Q5UBV8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf15Q5UBV8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf15Q5UBV8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf15Q5UBV8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf15Q5UBV8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf15Q5UBV8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf15Q5UBV8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf15Q5UBV8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf15Q5UBV8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf15Q5UBV8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf15Q5UBV8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf15Q5UBV8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf15Q5UBV8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf15Q5UBV8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf15Q5UBV8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf15Q5UBV8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf15Q5UBV8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf15Q5UBV8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf15Q5UBV8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf15Q5UBV8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf15Q5UBV8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf15Q5UBV8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf15Q5UBV8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf15Q5UBV8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf15Q5UBV8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf15Q5UBV8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf15Q5UBV8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf15Q5UBV8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf15Q5UBV8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf15Q5UBV8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf15Q5UBV8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf15Q5UBV8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf15Q5UBV8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf15Q5UBV8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf15Q5UBV8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf15Q5UBV8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf15Q5UBV8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnfsf15Q5UBV8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf15Q5UBV8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf15Q5UBV8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tnfsf15Q5UBV8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnfsf15Q5UBV8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms