Protein–RNA interactions for Protein: Q58A45

PAN3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit PAN3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3Q58A45 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms