Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB6CQ53S08 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB6CQ53S08 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RAB6CQ53S08 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB6CQ53S08 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms