Protein–RNA interactions for Protein: Q4U4S6

Xirp2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp2Q4U4S6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Xirp2Q4U4S6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Xirp2Q4U4S6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Xirp2Q4U4S6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Xirp2Q4U4S6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Xirp2Q4U4S6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Xirp2Q4U4S6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Xirp2Q4U4S6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Xirp2Q4U4S6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Xirp2Q4U4S6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Xirp2Q4U4S6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Xirp2Q4U4S6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Xirp2Q4U4S6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Xirp2Q4U4S6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Xirp2Q4U4S6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Xirp2Q4U4S6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Xirp2Q4U4S6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Xirp2Q4U4S6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Xirp2Q4U4S6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Xirp2Q4U4S6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Xirp2Q4U4S6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Xirp2Q4U4S6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Xirp2Q4U4S6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Xirp2Q4U4S6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Xirp2Q4U4S6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Xirp2Q4U4S6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xirp2Q4U4S6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xirp2Q4U4S6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xirp2Q4U4S6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Xirp2Q4U4S6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xirp2Q4U4S6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xirp2Q4U4S6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xirp2Q4U4S6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xirp2Q4U4S6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xirp2Q4U4S6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xirp2Q4U4S6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xirp2Q4U4S6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xirp2Q4U4S6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xirp2Q4U4S6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xirp2Q4U4S6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xirp2Q4U4S6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Xirp2Q4U4S6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xirp2Q4U4S6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xirp2Q4U4S6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xirp2Q4U4S6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xirp2Q4U4S6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xirp2Q4U4S6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xirp2Q4U4S6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xirp2Q4U4S6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Xirp2Q4U4S6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xirp2Q4U4S6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Xirp2Q4U4S6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xirp2Q4U4S6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xirp2Q4U4S6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xirp2Q4U4S6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xirp2Q4U4S6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xirp2Q4U4S6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xirp2Q4U4S6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xirp2Q4U4S6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xirp2Q4U4S6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xirp2Q4U4S6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xirp2Q4U4S6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Xirp2Q4U4S6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xirp2Q4U4S6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xirp2Q4U4S6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xirp2Q4U4S6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xirp2Q4U4S6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xirp2Q4U4S6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xirp2Q4U4S6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xirp2Q4U4S6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Xirp2Q4U4S6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Xirp2Q4U4S6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Xirp2Q4U4S6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Xirp2Q4U4S6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Xirp2Q4U4S6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Xirp2Q4U4S6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Xirp2Q4U4S6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Xirp2Q4U4S6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Xirp2Q4U4S6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Xirp2Q4U4S6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Xirp2Q4U4S6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Xirp2Q4U4S6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Xirp2Q4U4S6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Xirp2Q4U4S6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Xirp2Q4U4S6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Xirp2Q4U4S6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Xirp2Q4U4S6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Xirp2Q4U4S6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Xirp2Q4U4S6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Xirp2Q4U4S6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Xirp2Q4U4S6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Xirp2Q4U4S6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Xirp2Q4U4S6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Xirp2Q4U4S6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Xirp2Q4U4S6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Xirp2Q4U4S6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Xirp2Q4U4S6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Xirp2Q4U4S6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Xirp2Q4U4S6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Xirp2Q4U4S6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms