Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc160Q3UYG1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc160Q3UYG1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc160Q3UYG1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc160Q3UYG1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc160Q3UYG1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc160Q3UYG1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc160Q3UYG1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc160Q3UYG1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc160Q3UYG1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc160Q3UYG1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc160Q3UYG1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc160Q3UYG1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc160Q3UYG1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc160Q3UYG1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc160Q3UYG1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc160Q3UYG1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc160Q3UYG1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc160Q3UYG1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc160Q3UYG1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc160Q3UYG1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc160Q3UYG1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc160Q3UYG1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc160Q3UYG1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc160Q3UYG1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc160Q3UYG1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc160Q3UYG1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc160Q3UYG1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc160Q3UYG1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc160Q3UYG1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc160Q3UYG1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc160Q3UYG1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc160Q3UYG1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc160Q3UYG1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc160Q3UYG1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc160Q3UYG1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc160Q3UYG1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc160Q3UYG1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc160Q3UYG1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc160Q3UYG1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc160Q3UYG1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc160Q3UYG1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc160Q3UYG1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc160Q3UYG1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc160Q3UYG1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc160Q3UYG1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc160Q3UYG1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc160Q3UYG1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc160Q3UYG1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc160Q3UYG1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc160Q3UYG1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc160Q3UYG1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc160Q3UYG1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc160Q3UYG1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc160Q3UYG1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc160Q3UYG1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc160Q3UYG1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc160Q3UYG1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc160Q3UYG1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc160Q3UYG1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc160Q3UYG1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc160Q3UYG1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc160Q3UYG1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc160Q3UYG1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc160Q3UYG1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc160Q3UYG1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc160Q3UYG1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc160Q3UYG1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc160Q3UYG1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc160Q3UYG1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc160Q3UYG1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc160Q3UYG1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc160Q3UYG1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc160Q3UYG1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc160Q3UYG1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc160Q3UYG1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc160Q3UYG1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc160Q3UYG1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc160Q3UYG1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc160Q3UYG1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc160Q3UYG1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc160Q3UYG1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc160Q3UYG1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc160Q3UYG1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc160Q3UYG1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc160Q3UYG1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc160Q3UYG1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc160Q3UYG1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc160Q3UYG1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc160Q3UYG1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc160Q3UYG1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc160Q3UYG1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc160Q3UYG1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc160Q3UYG1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc160Q3UYG1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc160Q3UYG1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc160Q3UYG1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc160Q3UYG1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc160Q3UYG1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc160Q3UYG1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms