Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW98

Clca4b, Chloride channel accessory 4B, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca4bQ3UW98 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clca4bQ3UW98 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clca4bQ3UW98 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clca4bQ3UW98 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clca4bQ3UW98 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clca4bQ3UW98 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clca4bQ3UW98 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clca4bQ3UW98 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clca4bQ3UW98 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clca4bQ3UW98 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms