Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKU4

Fam83f, Protein FAM83F, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam83fQ3UKU4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam83fQ3UKU4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam83fQ3UKU4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam83fQ3UKU4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam83fQ3UKU4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam83fQ3UKU4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam83fQ3UKU4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam83fQ3UKU4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam83fQ3UKU4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam83fQ3UKU4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam83fQ3UKU4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam83fQ3UKU4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam83fQ3UKU4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam83fQ3UKU4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam83fQ3UKU4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam83fQ3UKU4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam83fQ3UKU4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam83fQ3UKU4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam83fQ3UKU4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam83fQ3UKU4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam83fQ3UKU4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam83fQ3UKU4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam83fQ3UKU4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam83fQ3UKU4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam83fQ3UKU4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam83fQ3UKU4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam83fQ3UKU4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam83fQ3UKU4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam83fQ3UKU4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fam83fQ3UKU4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fam83fQ3UKU4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fam83fQ3UKU4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fam83fQ3UKU4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fam83fQ3UKU4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Fam83fQ3UKU4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fam83fQ3UKU4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fam83fQ3UKU4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fam83fQ3UKU4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fam83fQ3UKU4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Fam83fQ3UKU4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fam83fQ3UKU4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fam83fQ3UKU4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fam83fQ3UKU4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fam83fQ3UKU4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Fam83fQ3UKU4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fam83fQ3UKU4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fam83fQ3UKU4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fam83fQ3UKU4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fam83fQ3UKU4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fam83fQ3UKU4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fam83fQ3UKU4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fam83fQ3UKU4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam83fQ3UKU4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam83fQ3UKU4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam83fQ3UKU4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam83fQ3UKU4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam83fQ3UKU4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam83fQ3UKU4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam83fQ3UKU4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam83fQ3UKU4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam83fQ3UKU4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam83fQ3UKU4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam83fQ3UKU4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam83fQ3UKU4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam83fQ3UKU4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam83fQ3UKU4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam83fQ3UKU4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam83fQ3UKU4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam83fQ3UKU4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam83fQ3UKU4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam83fQ3UKU4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam83fQ3UKU4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam83fQ3UKU4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam83fQ3UKU4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam83fQ3UKU4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam83fQ3UKU4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam83fQ3UKU4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam83fQ3UKU4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam83fQ3UKU4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam83fQ3UKU4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam83fQ3UKU4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam83fQ3UKU4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam83fQ3UKU4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam83fQ3UKU4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam83fQ3UKU4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam83fQ3UKU4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam83fQ3UKU4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam83fQ3UKU4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam83fQ3UKU4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam83fQ3UKU4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam83fQ3UKU4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam83fQ3UKU4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam83fQ3UKU4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam83fQ3UKU4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam83fQ3UKU4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam83fQ3UKU4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam83fQ3UKU4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam83fQ3UKU4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam83fQ3UKU4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam83fQ3UKU4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms