Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9G9

Lbr, Lamin-B receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbrQ3U9G9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LbrQ3U9G9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LbrQ3U9G9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LbrQ3U9G9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LbrQ3U9G9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LbrQ3U9G9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LbrQ3U9G9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LbrQ3U9G9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LbrQ3U9G9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LbrQ3U9G9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LbrQ3U9G9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LbrQ3U9G9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LbrQ3U9G9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LbrQ3U9G9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LbrQ3U9G9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LbrQ3U9G9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LbrQ3U9G9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LbrQ3U9G9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LbrQ3U9G9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LbrQ3U9G9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LbrQ3U9G9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LbrQ3U9G9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LbrQ3U9G9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LbrQ3U9G9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LbrQ3U9G9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LbrQ3U9G9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LbrQ3U9G9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LbrQ3U9G9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LbrQ3U9G9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LbrQ3U9G9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LbrQ3U9G9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LbrQ3U9G9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LbrQ3U9G9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LbrQ3U9G9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LbrQ3U9G9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LbrQ3U9G9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LbrQ3U9G9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LbrQ3U9G9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LbrQ3U9G9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LbrQ3U9G9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LbrQ3U9G9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LbrQ3U9G9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LbrQ3U9G9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LbrQ3U9G9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LbrQ3U9G9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LbrQ3U9G9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LbrQ3U9G9 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LbrQ3U9G9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LbrQ3U9G9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LbrQ3U9G9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LbrQ3U9G9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LbrQ3U9G9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LbrQ3U9G9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LbrQ3U9G9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LbrQ3U9G9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LbrQ3U9G9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LbrQ3U9G9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LbrQ3U9G9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LbrQ3U9G9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LbrQ3U9G9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LbrQ3U9G9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LbrQ3U9G9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LbrQ3U9G9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LbrQ3U9G9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LbrQ3U9G9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LbrQ3U9G9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LbrQ3U9G9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LbrQ3U9G9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LbrQ3U9G9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LbrQ3U9G9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LbrQ3U9G9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LbrQ3U9G9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LbrQ3U9G9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LbrQ3U9G9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LbrQ3U9G9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LbrQ3U9G9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LbrQ3U9G9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LbrQ3U9G9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LbrQ3U9G9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LbrQ3U9G9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LbrQ3U9G9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LbrQ3U9G9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LbrQ3U9G9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LbrQ3U9G9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LbrQ3U9G9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LbrQ3U9G9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LbrQ3U9G9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LbrQ3U9G9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LbrQ3U9G9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LbrQ3U9G9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LbrQ3U9G9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LbrQ3U9G9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LbrQ3U9G9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LbrQ3U9G9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LbrQ3U9G9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LbrQ3U9G9 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LbrQ3U9G9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LbrQ3U9G9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LbrQ3U9G9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LbrQ3U9G9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 170.1 ms