Protein–RNA interactions for Protein: Q2PFD7

Psd3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psd3Q2PFD7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psd3Q2PFD7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Psd3Q2PFD7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Psd3Q2PFD7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Psd3Q2PFD7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Psd3Q2PFD7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Psd3Q2PFD7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psd3Q2PFD7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psd3Q2PFD7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Psd3Q2PFD7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psd3Q2PFD7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psd3Q2PFD7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psd3Q2PFD7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psd3Q2PFD7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psd3Q2PFD7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psd3Q2PFD7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psd3Q2PFD7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psd3Q2PFD7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psd3Q2PFD7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Psd3Q2PFD7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Psd3Q2PFD7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Psd3Q2PFD7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Psd3Q2PFD7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Psd3Q2PFD7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Psd3Q2PFD7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Psd3Q2PFD7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Psd3Q2PFD7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Psd3Q2PFD7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Psd3Q2PFD7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Psd3Q2PFD7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Psd3Q2PFD7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psd3Q2PFD7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psd3Q2PFD7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psd3Q2PFD7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psd3Q2PFD7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psd3Q2PFD7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psd3Q2PFD7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psd3Q2PFD7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psd3Q2PFD7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psd3Q2PFD7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psd3Q2PFD7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psd3Q2PFD7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psd3Q2PFD7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psd3Q2PFD7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psd3Q2PFD7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psd3Q2PFD7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psd3Q2PFD7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psd3Q2PFD7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Psd3Q2PFD7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Psd3Q2PFD7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psd3Q2PFD7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psd3Q2PFD7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psd3Q2PFD7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psd3Q2PFD7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psd3Q2PFD7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Psd3Q2PFD7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Psd3Q2PFD7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Psd3Q2PFD7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Psd3Q2PFD7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Psd3Q2PFD7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Psd3Q2PFD7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Psd3Q2PFD7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Psd3Q2PFD7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Psd3Q2PFD7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Psd3Q2PFD7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psd3Q2PFD7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psd3Q2PFD7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psd3Q2PFD7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psd3Q2PFD7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psd3Q2PFD7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psd3Q2PFD7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psd3Q2PFD7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psd3Q2PFD7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psd3Q2PFD7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psd3Q2PFD7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psd3Q2PFD7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psd3Q2PFD7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psd3Q2PFD7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psd3Q2PFD7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psd3Q2PFD7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psd3Q2PFD7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psd3Q2PFD7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psd3Q2PFD7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psd3Q2PFD7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Psd3Q2PFD7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psd3Q2PFD7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psd3Q2PFD7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psd3Q2PFD7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psd3Q2PFD7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psd3Q2PFD7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psd3Q2PFD7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psd3Q2PFD7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psd3Q2PFD7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psd3Q2PFD7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Psd3Q2PFD7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Psd3Q2PFD7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Psd3Q2PFD7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Psd3Q2PFD7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Psd3Q2PFD7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Psd3Q2PFD7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms