Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHD4Q14839 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHD4Q14839 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHD4Q14839 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHD4Q14839 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHD4Q14839 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHD4Q14839 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHD4Q14839 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHD4Q14839 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHD4Q14839 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHD4Q14839 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHD4Q14839 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CHD4Q14839 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CHD4Q14839 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CHD4Q14839 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
CHD4Q14839 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CHD4Q14839 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHD4Q14839 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHD4Q14839 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHD4Q14839 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHD4Q14839 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHD4Q14839 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHD4Q14839 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHD4Q14839 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHD4Q14839 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHD4Q14839 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHD4Q14839 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHD4Q14839 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHD4Q14839 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHD4Q14839 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHD4Q14839 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHD4Q14839 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHD4Q14839 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHD4Q14839 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHD4Q14839 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHD4Q14839 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHD4Q14839 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHD4Q14839 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHD4Q14839 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHD4Q14839 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHD4Q14839 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHD4Q14839 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHD4Q14839 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHD4Q14839 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHD4Q14839 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHD4Q14839 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CHD4Q14839 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHD4Q14839 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHD4Q14839 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHD4Q14839 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHD4Q14839 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHD4Q14839 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHD4Q14839 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHD4Q14839 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHD4Q14839 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHD4Q14839 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHD4Q14839 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CHD4Q14839 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHD4Q14839 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHD4Q14839 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHD4Q14839 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHD4Q14839 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHD4Q14839 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHD4Q14839 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CHD4Q14839 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CHD4Q14839 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHD4Q14839 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHD4Q14839 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHD4Q14839 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHD4Q14839 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHD4Q14839 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHD4Q14839 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHD4Q14839 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHD4Q14839 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHD4Q14839 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHD4Q14839 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHD4Q14839 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHD4Q14839 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHD4Q14839 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CHD4Q14839 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHD4Q14839 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHD4Q14839 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHD4Q14839 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CHD4Q14839 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CHD4Q14839 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CHD4Q14839 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CHD4Q14839 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CHD4Q14839 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CHD4Q14839 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
CHD4Q14839 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHD4Q14839 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHD4Q14839 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHD4Q14839 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHD4Q14839 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHD4Q14839 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHD4Q14839 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHD4Q14839 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHD4Q14839 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHD4Q14839 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHD4Q14839 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
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