Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBE4AQ14139 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBE4AQ14139 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
UBE4AQ14139 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
UBE4AQ14139 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBE4AQ14139 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBE4AQ14139 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBE4AQ14139 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBE4AQ14139 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBE4AQ14139 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBE4AQ14139 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBE4AQ14139 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBE4AQ14139 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBE4AQ14139 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBE4AQ14139 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBE4AQ14139 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBE4AQ14139 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBE4AQ14139 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBE4AQ14139 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBE4AQ14139 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBE4AQ14139 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBE4AQ14139 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBE4AQ14139 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBE4AQ14139 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBE4AQ14139 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBE4AQ14139 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBE4AQ14139 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBE4AQ14139 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBE4AQ14139 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
UBE4AQ14139 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
UBE4AQ14139 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
UBE4AQ14139 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
UBE4AQ14139 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
UBE4AQ14139 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
UBE4AQ14139 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
UBE4AQ14139 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
UBE4AQ14139 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBE4AQ14139 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBE4AQ14139 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBE4AQ14139 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
UBE4AQ14139 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBE4AQ14139 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
UBE4AQ14139 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
UBE4AQ14139 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBE4AQ14139 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBE4AQ14139 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBE4AQ14139 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBE4AQ14139 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBE4AQ14139 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBE4AQ14139 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBE4AQ14139 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBE4AQ14139 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
UBE4AQ14139 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBE4AQ14139 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
UBE4AQ14139 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBE4AQ14139 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBE4AQ14139 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBE4AQ14139 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBE4AQ14139 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBE4AQ14139 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBE4AQ14139 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBE4AQ14139 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBE4AQ14139 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBE4AQ14139 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBE4AQ14139 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBE4AQ14139 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBE4AQ14139 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBE4AQ14139 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBE4AQ14139 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBE4AQ14139 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBE4AQ14139 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBE4AQ14139 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBE4AQ14139 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBE4AQ14139 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
UBE4AQ14139 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBE4AQ14139 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBE4AQ14139 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBE4AQ14139 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBE4AQ14139 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBE4AQ14139 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBE4AQ14139 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBE4AQ14139 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBE4AQ14139 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBE4AQ14139 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBE4AQ14139 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBE4AQ14139 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBE4AQ14139 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBE4AQ14139 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBE4AQ14139 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBE4AQ14139 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
UBE4AQ14139 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
UBE4AQ14139 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
UBE4AQ14139 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
UBE4AQ14139 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
UBE4AQ14139 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
UBE4AQ14139 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
UBE4AQ14139 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
UBE4AQ14139 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
UBE4AQ14139 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
UBE4AQ14139 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
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