Protein–RNA interactions for Protein: Q09324

Gcnt1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcnt1Q09324 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gcnt1Q09324 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gcnt1Q09324 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gcnt1Q09324 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gcnt1Q09324 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gcnt1Q09324 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gcnt1Q09324 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gcnt1Q09324 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gcnt1Q09324 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gcnt1Q09324 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gcnt1Q09324 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gcnt1Q09324 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gcnt1Q09324 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gcnt1Q09324 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gcnt1Q09324 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gcnt1Q09324 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gcnt1Q09324 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gcnt1Q09324 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gcnt1Q09324 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Gcnt1Q09324 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gcnt1Q09324 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gcnt1Q09324 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gcnt1Q09324 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gcnt1Q09324 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gcnt1Q09324 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gcnt1Q09324 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gcnt1Q09324 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gcnt1Q09324 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gcnt1Q09324 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gcnt1Q09324 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Gcnt1Q09324 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gcnt1Q09324 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gcnt1Q09324 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gcnt1Q09324 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gcnt1Q09324 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gcnt1Q09324 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gcnt1Q09324 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gcnt1Q09324 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gcnt1Q09324 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gcnt1Q09324 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gcnt1Q09324 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gcnt1Q09324 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gcnt1Q09324 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gcnt1Q09324 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gcnt1Q09324 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gcnt1Q09324 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gcnt1Q09324 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gcnt1Q09324 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gcnt1Q09324 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Gcnt1Q09324 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gcnt1Q09324 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gcnt1Q09324 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gcnt1Q09324 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gcnt1Q09324 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gcnt1Q09324 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gcnt1Q09324 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gcnt1Q09324 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gcnt1Q09324 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Gcnt1Q09324 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gcnt1Q09324 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gcnt1Q09324 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gcnt1Q09324 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gcnt1Q09324 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gcnt1Q09324 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gcnt1Q09324 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gcnt1Q09324 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gcnt1Q09324 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gcnt1Q09324 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gcnt1Q09324 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gcnt1Q09324 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gcnt1Q09324 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gcnt1Q09324 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gcnt1Q09324 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gcnt1Q09324 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gcnt1Q09324 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gcnt1Q09324 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gcnt1Q09324 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gcnt1Q09324 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gcnt1Q09324 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gcnt1Q09324 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Gcnt1Q09324 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gcnt1Q09324 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gcnt1Q09324 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gcnt1Q09324 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gcnt1Q09324 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gcnt1Q09324 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gcnt1Q09324 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gcnt1Q09324 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gcnt1Q09324 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gcnt1Q09324 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gcnt1Q09324 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gcnt1Q09324 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gcnt1Q09324 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gcnt1Q09324 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gcnt1Q09324 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gcnt1Q09324 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gcnt1Q09324 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gcnt1Q09324 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gcnt1Q09324 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gcnt1Q09324 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms