Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DSC1Q08554 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
DSC1Q08554 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DSC1Q08554 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DSC1Q08554 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DSC1Q08554 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DSC1Q08554 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
DSC1Q08554 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DSC1Q08554 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DSC1Q08554 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DSC1Q08554 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms