Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MestQ07646 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MestQ07646 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
MestQ07646 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MestQ07646 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MestQ07646 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MestQ07646 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MestQ07646 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MestQ07646 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MestQ07646 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MestQ07646 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MestQ07646 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MestQ07646 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MestQ07646 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MestQ07646 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MestQ07646 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MestQ07646 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MestQ07646 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MestQ07646 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
MestQ07646 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MestQ07646 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MestQ07646 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MestQ07646 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MestQ07646 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MestQ07646 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MestQ07646 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MestQ07646 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MestQ07646 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MestQ07646 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MestQ07646 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MestQ07646 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MestQ07646 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MestQ07646 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MestQ07646 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MestQ07646 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MestQ07646 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
MestQ07646 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MestQ07646 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MestQ07646 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MestQ07646 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MestQ07646 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MestQ07646 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MestQ07646 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MestQ07646 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MestQ07646 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MestQ07646 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MestQ07646 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MestQ07646 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MestQ07646 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MestQ07646 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MestQ07646 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
MestQ07646 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MestQ07646 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MestQ07646 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MestQ07646 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MestQ07646 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MestQ07646 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MestQ07646 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MestQ07646 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MestQ07646 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MestQ07646 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MestQ07646 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MestQ07646 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
MestQ07646 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MestQ07646 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MestQ07646 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MestQ07646 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MestQ07646 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MestQ07646 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MestQ07646 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MestQ07646 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MestQ07646 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MestQ07646 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MestQ07646 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MestQ07646 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MestQ07646 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MestQ07646 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MestQ07646 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MestQ07646 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
MestQ07646 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MestQ07646 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MestQ07646 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MestQ07646 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MestQ07646 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MestQ07646 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MestQ07646 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MestQ07646 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MestQ07646 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MestQ07646 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MestQ07646 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
MestQ07646 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MestQ07646 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MestQ07646 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MestQ07646 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MestQ07646 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MestQ07646 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MestQ07646 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MestQ07646 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MestQ07646 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MestQ07646 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms