Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NrepQ07475 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NrepQ07475 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NrepQ07475 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
NrepQ07475 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NrepQ07475 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NrepQ07475 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NrepQ07475 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms