Protein–RNA interactions for Protein: Q06666

Srst, Octapeptide-repeat protein T2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrstQ06666 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrstQ06666 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SrstQ06666 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SrstQ06666 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrstQ06666 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrstQ06666 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SrstQ06666 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SrstQ06666 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrstQ06666 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrstQ06666 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrstQ06666 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrstQ06666 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrstQ06666 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrstQ06666 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrstQ06666 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SrstQ06666 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrstQ06666 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SrstQ06666 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrstQ06666 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SrstQ06666 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrstQ06666 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SrstQ06666 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SrstQ06666 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SrstQ06666 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrstQ06666 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrstQ06666 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SrstQ06666 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrstQ06666 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrstQ06666 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SrstQ06666 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrstQ06666 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SrstQ06666 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SrstQ06666 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrstQ06666 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrstQ06666 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrstQ06666 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SrstQ06666 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrstQ06666 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrstQ06666 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrstQ06666 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SrstQ06666 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SrstQ06666 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrstQ06666 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrstQ06666 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrstQ06666 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrstQ06666 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrstQ06666 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SrstQ06666 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrstQ06666 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SrstQ06666 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrstQ06666 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrstQ06666 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrstQ06666 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrstQ06666 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SrstQ06666 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SrstQ06666 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SrstQ06666 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SrstQ06666 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SrstQ06666 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SrstQ06666 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SrstQ06666 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SrstQ06666 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SrstQ06666 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SrstQ06666 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrstQ06666 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrstQ06666 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrstQ06666 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SrstQ06666 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SrstQ06666 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SrstQ06666 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SrstQ06666 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrstQ06666 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrstQ06666 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrstQ06666 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrstQ06666 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrstQ06666 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SrstQ06666 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrstQ06666 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrstQ06666 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SrstQ06666 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SrstQ06666 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SrstQ06666 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrstQ06666 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SrstQ06666 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrstQ06666 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SrstQ06666 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrstQ06666 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrstQ06666 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SrstQ06666 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrstQ06666 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrstQ06666 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SrstQ06666 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrstQ06666 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SrstQ06666 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms