Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Apoc2Q05020 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms