Protein–RNA interactions for Protein: Q03719

Kcnd1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnd1Q03719 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Kcnd1Q03719 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Kcnd1Q03719 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Kcnd1Q03719 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Kcnd1Q03719 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Kcnd1Q03719 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Kcnd1Q03719 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Kcnd1Q03719 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Kcnd1Q03719 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Kcnd1Q03719 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Kcnd1Q03719 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Kcnd1Q03719 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Kcnd1Q03719 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Kcnd1Q03719 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Kcnd1Q03719 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Kcnd1Q03719 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Kcnd1Q03719 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Kcnd1Q03719 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Kcnd1Q03719 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Kcnd1Q03719 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Kcnd1Q03719 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Kcnd1Q03719 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Kcnd1Q03719 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Kcnd1Q03719 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kcnd1Q03719 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kcnd1Q03719 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kcnd1Q03719 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kcnd1Q03719 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kcnd1Q03719 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kcnd1Q03719 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Kcnd1Q03719 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kcnd1Q03719 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kcnd1Q03719 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kcnd1Q03719 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kcnd1Q03719 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kcnd1Q03719 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kcnd1Q03719 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kcnd1Q03719 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kcnd1Q03719 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kcnd1Q03719 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kcnd1Q03719 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Kcnd1Q03719 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kcnd1Q03719 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Kcnd1Q03719 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kcnd1Q03719 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kcnd1Q03719 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kcnd1Q03719 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kcnd1Q03719 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kcnd1Q03719 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kcnd1Q03719 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kcnd1Q03719 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kcnd1Q03719 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kcnd1Q03719 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kcnd1Q03719 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kcnd1Q03719 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kcnd1Q03719 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kcnd1Q03719 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kcnd1Q03719 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kcnd1Q03719 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kcnd1Q03719 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kcnd1Q03719 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kcnd1Q03719 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kcnd1Q03719 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kcnd1Q03719 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kcnd1Q03719 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Kcnd1Q03719 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kcnd1Q03719 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kcnd1Q03719 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Kcnd1Q03719 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kcnd1Q03719 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kcnd1Q03719 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kcnd1Q03719 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kcnd1Q03719 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kcnd1Q03719 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kcnd1Q03719 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kcnd1Q03719 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kcnd1Q03719 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kcnd1Q03719 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kcnd1Q03719 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kcnd1Q03719 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Kcnd1Q03719 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Kcnd1Q03719 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Kcnd1Q03719 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Kcnd1Q03719 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Kcnd1Q03719 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Kcnd1Q03719 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kcnd1Q03719 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kcnd1Q03719 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kcnd1Q03719 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kcnd1Q03719 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kcnd1Q03719 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kcnd1Q03719 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kcnd1Q03719 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kcnd1Q03719 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kcnd1Q03719 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kcnd1Q03719 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kcnd1Q03719 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kcnd1Q03719 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kcnd1Q03719 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kcnd1Q03719 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms