Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Msx2Q03358 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Msx2Q03358 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msx2Q03358 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msx2Q03358 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msx2Q03358 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msx2Q03358 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Msx2Q03358 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msx2Q03358 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msx2Q03358 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msx2Q03358 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msx2Q03358 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msx2Q03358 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Msx2Q03358 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Msx2Q03358 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Msx2Q03358 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Msx2Q03358 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Msx2Q03358 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Msx2Q03358 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Msx2Q03358 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Msx2Q03358 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Msx2Q03358 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Msx2Q03358 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Msx2Q03358 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Msx2Q03358 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Msx2Q03358 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Msx2Q03358 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Msx2Q03358 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Msx2Q03358 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Msx2Q03358 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Msx2Q03358 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Msx2Q03358 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Msx2Q03358 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Msx2Q03358 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Msx2Q03358 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Msx2Q03358 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Msx2Q03358 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msx2Q03358 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msx2Q03358 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msx2Q03358 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msx2Q03358 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msx2Q03358 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msx2Q03358 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msx2Q03358 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msx2Q03358 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Msx2Q03358 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msx2Q03358 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msx2Q03358 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Msx2Q03358 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Msx2Q03358 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Msx2Q03358 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Msx2Q03358 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Msx2Q03358 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms