Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NfiaQ02780 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NfiaQ02780 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NfiaQ02780 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
NfiaQ02780 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NfiaQ02780 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NfiaQ02780 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NfiaQ02780 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NfiaQ02780 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NfiaQ02780 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NfiaQ02780 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NfiaQ02780 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NfiaQ02780 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NfiaQ02780 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NfiaQ02780 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NfiaQ02780 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NfiaQ02780 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NfiaQ02780 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NfiaQ02780 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NfiaQ02780 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NfiaQ02780 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NfiaQ02780 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NfiaQ02780 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NfiaQ02780 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NfiaQ02780 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NfiaQ02780 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NfiaQ02780 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NfiaQ02780 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NfiaQ02780 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NfiaQ02780 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NfiaQ02780 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NfiaQ02780 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NfiaQ02780 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NfiaQ02780 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NfiaQ02780 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NfiaQ02780 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NfiaQ02780 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NfiaQ02780 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NfiaQ02780 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NfiaQ02780 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NfiaQ02780 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NfiaQ02780 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NfiaQ02780 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NfiaQ02780 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NfiaQ02780 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NfiaQ02780 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NfiaQ02780 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NfiaQ02780 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NfiaQ02780 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NfiaQ02780 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NfiaQ02780 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NfiaQ02780 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NfiaQ02780 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NfiaQ02780 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NfiaQ02780 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NfiaQ02780 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NfiaQ02780 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NfiaQ02780 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NfiaQ02780 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NfiaQ02780 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NfiaQ02780 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NfiaQ02780 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NfiaQ02780 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NfiaQ02780 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NfiaQ02780 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NfiaQ02780 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NfiaQ02780 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NfiaQ02780 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NfiaQ02780 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NfiaQ02780 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NfiaQ02780 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NfiaQ02780 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NfiaQ02780 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NfiaQ02780 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NfiaQ02780 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NfiaQ02780 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NfiaQ02780 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NfiaQ02780 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NfiaQ02780 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NfiaQ02780 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NfiaQ02780 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NfiaQ02780 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NfiaQ02780 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NfiaQ02780 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NfiaQ02780 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NfiaQ02780 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NfiaQ02780 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NfiaQ02780 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NfiaQ02780 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NfiaQ02780 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NfiaQ02780 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NfiaQ02780 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NfiaQ02780 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NfiaQ02780 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NfiaQ02780 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NfiaQ02780 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NfiaQ02780 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NfiaQ02780 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NfiaQ02780 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NfiaQ02780 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms