Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gjb4Q02738 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gjb4Q02738 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gjb4Q02738 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gjb4Q02738 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gjb4Q02738 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gjb4Q02738 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gjb4Q02738 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gjb4Q02738 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gjb4Q02738 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gjb4Q02738 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gjb4Q02738 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gjb4Q02738 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gjb4Q02738 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gjb4Q02738 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gjb4Q02738 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gjb4Q02738 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gjb4Q02738 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gjb4Q02738 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gjb4Q02738 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gjb4Q02738 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gjb4Q02738 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gjb4Q02738 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gjb4Q02738 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gjb4Q02738 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gjb4Q02738 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gjb4Q02738 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gjb4Q02738 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gjb4Q02738 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gjb4Q02738 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gjb4Q02738 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gjb4Q02738 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gjb4Q02738 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gjb4Q02738 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gjb4Q02738 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gjb4Q02738 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gjb4Q02738 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gjb4Q02738 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gjb4Q02738 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gjb4Q02738 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gjb4Q02738 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gjb4Q02738 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gjb4Q02738 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gjb4Q02738 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gjb4Q02738 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Gjb4Q02738 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gjb4Q02738 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gjb4Q02738 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gjb4Q02738 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gjb4Q02738 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gjb4Q02738 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gjb4Q02738 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gjb4Q02738 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gjb4Q02738 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gjb4Q02738 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Gjb4Q02738 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Gjb4Q02738 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Gjb4Q02738 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gjb4Q02738 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gjb4Q02738 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gjb4Q02738 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gjb4Q02738 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gjb4Q02738 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gjb4Q02738 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gjb4Q02738 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gjb4Q02738 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gjb4Q02738 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gjb4Q02738 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gjb4Q02738 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Gjb4Q02738 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gjb4Q02738 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gjb4Q02738 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gjb4Q02738 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Gjb4Q02738 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gjb4Q02738 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gjb4Q02738 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gjb4Q02738 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Gjb4Q02738 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gjb4Q02738 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gjb4Q02738 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gjb4Q02738 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gjb4Q02738 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gjb4Q02738 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gjb4Q02738 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gjb4Q02738 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gjb4Q02738 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gjb4Q02738 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gjb4Q02738 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gjb4Q02738 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gjb4Q02738 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gjb4Q02738 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gjb4Q02738 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gjb4Q02738 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gjb4Q02738 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gjb4Q02738 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gjb4Q02738 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gjb4Q02738 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gjb4Q02738 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gjb4Q02738 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gjb4Q02738 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms