Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnnb1Q02248 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnnb1Q02248 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnnb1Q02248 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnnb1Q02248 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnnb1Q02248 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnnb1Q02248 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnnb1Q02248 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnnb1Q02248 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnnb1Q02248 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnnb1Q02248 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnnb1Q02248 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnnb1Q02248 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnnb1Q02248 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnnb1Q02248 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnnb1Q02248 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnnb1Q02248 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctnnb1Q02248 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctnnb1Q02248 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctnnb1Q02248 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctnnb1Q02248 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctnnb1Q02248 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctnnb1Q02248 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctnnb1Q02248 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctnnb1Q02248 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctnnb1Q02248 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctnnb1Q02248 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctnnb1Q02248 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctnnb1Q02248 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctnnb1Q02248 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctnnb1Q02248 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctnnb1Q02248 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctnnb1Q02248 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctnnb1Q02248 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctnnb1Q02248 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctnnb1Q02248 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctnnb1Q02248 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctnnb1Q02248 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctnnb1Q02248 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctnnb1Q02248 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctnnb1Q02248 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctnnb1Q02248 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctnnb1Q02248 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctnnb1Q02248 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctnnb1Q02248 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctnnb1Q02248 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctnnb1Q02248 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctnnb1Q02248 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctnnb1Q02248 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctnnb1Q02248 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctnnb1Q02248 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctnnb1Q02248 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctnnb1Q02248 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctnnb1Q02248 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctnnb1Q02248 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctnnb1Q02248 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ctnnb1Q02248 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctnnb1Q02248 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctnnb1Q02248 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctnnb1Q02248 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctnnb1Q02248 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctnnb1Q02248 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctnnb1Q02248 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctnnb1Q02248 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ctnnb1Q02248 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ctnnb1Q02248 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ctnnb1Q02248 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ctnnb1Q02248 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ctnnb1Q02248 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ctnnb1Q02248 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ctnnb1Q02248 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctnnb1Q02248 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctnnb1Q02248 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctnnb1Q02248 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctnnb1Q02248 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctnnb1Q02248 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctnnb1Q02248 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctnnb1Q02248 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctnnb1Q02248 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctnnb1Q02248 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctnnb1Q02248 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctnnb1Q02248 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctnnb1Q02248 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctnnb1Q02248 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctnnb1Q02248 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctnnb1Q02248 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctnnb1Q02248 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctnnb1Q02248 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctnnb1Q02248 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctnnb1Q02248 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctnnb1Q02248 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctnnb1Q02248 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctnnb1Q02248 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctnnb1Q02248 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctnnb1Q02248 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctnnb1Q02248 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctnnb1Q02248 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctnnb1Q02248 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctnnb1Q02248 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctnnb1Q02248 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms