Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Irx2P81066 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Irx2P81066 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Irx2P81066 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Irx2P81066 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Irx2P81066 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Irx2P81066 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Irx2P81066 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Irx2P81066 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Irx2P81066 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Irx2P81066 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Irx2P81066 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Irx2P81066 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Irx2P81066 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Irx2P81066 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Irx2P81066 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Irx2P81066 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Irx2P81066 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Irx2P81066 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Irx2P81066 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Irx2P81066 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Irx2P81066 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Irx2P81066 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Irx2P81066 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Irx2P81066 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Irx2P81066 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Irx2P81066 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Irx2P81066 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Irx2P81066 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Irx2P81066 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Irx2P81066 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Irx2P81066 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Irx2P81066 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Irx2P81066 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Irx2P81066 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Irx2P81066 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Irx2P81066 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Irx2P81066 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Irx2P81066 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Irx2P81066 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Irx2P81066 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Irx2P81066 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Irx2P81066 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Irx2P81066 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Irx2P81066 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Irx2P81066 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Irx2P81066 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Irx2P81066 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Irx2P81066 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Irx2P81066 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Irx2P81066 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Irx2P81066 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Irx2P81066 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Irx2P81066 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Irx2P81066 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Irx2P81066 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Irx2P81066 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Irx2P81066 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Irx2P81066 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Irx2P81066 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Irx2P81066 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Irx2P81066 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Irx2P81066 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Irx2P81066 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Irx2P81066 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Irx2P81066 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Irx2P81066 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Irx2P81066 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Irx2P81066 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Irx2P81066 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Irx2P81066 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Irx2P81066 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Irx2P81066 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Irx2P81066 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Irx2P81066 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Irx2P81066 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Irx2P81066 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Irx2P81066 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Irx2P81066 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Irx2P81066 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Irx2P81066 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Irx2P81066 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Irx2P81066 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Irx2P81066 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Irx2P81066 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Irx2P81066 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Irx2P81066 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Irx2P81066 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Irx2P81066 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Irx2P81066 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Irx2P81066 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Irx2P81066 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Irx2P81066 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Irx2P81066 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Irx2P81066 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Irx2P81066 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Irx2P81066 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Irx2P81066 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Irx2P81066 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Irx2P81066 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms