Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nphp4P59240 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Nphp4P59240 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nphp4P59240 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nphp4P59240 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nphp4P59240 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nphp4P59240 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nphp4P59240 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nphp4P59240 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nphp4P59240 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Nphp4P59240 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nphp4P59240 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nphp4P59240 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nphp4P59240 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nphp4P59240 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nphp4P59240 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nphp4P59240 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nphp4P59240 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nphp4P59240 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nphp4P59240 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nphp4P59240 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nphp4P59240 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nphp4P59240 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nphp4P59240 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nphp4P59240 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nphp4P59240 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nphp4P59240 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Nphp4P59240 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nphp4P59240 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nphp4P59240 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nphp4P59240 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nphp4P59240 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nphp4P59240 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nphp4P59240 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nphp4P59240 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nphp4P59240 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nphp4P59240 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nphp4P59240 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nphp4P59240 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nphp4P59240 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nphp4P59240 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nphp4P59240 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nphp4P59240 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Nphp4P59240 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nphp4P59240 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nphp4P59240 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nphp4P59240 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nphp4P59240 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nphp4P59240 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nphp4P59240 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nphp4P59240 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Nphp4P59240 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nphp4P59240 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nphp4P59240 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Nphp4P59240 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nphp4P59240 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nphp4P59240 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nphp4P59240 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nphp4P59240 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nphp4P59240 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Nphp4P59240 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nphp4P59240 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nphp4P59240 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nphp4P59240 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nphp4P59240 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nphp4P59240 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Nphp4P59240 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nphp4P59240 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nphp4P59240 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nphp4P59240 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nphp4P59240 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nphp4P59240 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nphp4P59240 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nphp4P59240 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nphp4P59240 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nphp4P59240 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nphp4P59240 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nphp4P59240 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nphp4P59240 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nphp4P59240 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nphp4P59240 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nphp4P59240 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nphp4P59240 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nphp4P59240 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nphp4P59240 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nphp4P59240 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nphp4P59240 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nphp4P59240 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Nphp4P59240 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Nphp4P59240 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nphp4P59240 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nphp4P59240 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nphp4P59240 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nphp4P59240 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nphp4P59240 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nphp4P59240 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nphp4P59240 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nphp4P59240 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nphp4P59240 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nphp4P59240 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms