Protein–RNA interactions for Protein: P59114

Pcif1, Phosphorylated CTD-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcif1P59114 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcif1P59114 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcif1P59114 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcif1P59114 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcif1P59114 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcif1P59114 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcif1P59114 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcif1P59114 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcif1P59114 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcif1P59114 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcif1P59114 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcif1P59114 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcif1P59114 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcif1P59114 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcif1P59114 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcif1P59114 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcif1P59114 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcif1P59114 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcif1P59114 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcif1P59114 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcif1P59114 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcif1P59114 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcif1P59114 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcif1P59114 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcif1P59114 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcif1P59114 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcif1P59114 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcif1P59114 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcif1P59114 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcif1P59114 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcif1P59114 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcif1P59114 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcif1P59114 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcif1P59114 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcif1P59114 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcif1P59114 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcif1P59114 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcif1P59114 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcif1P59114 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcif1P59114 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Pcif1P59114 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcif1P59114 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcif1P59114 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcif1P59114 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcif1P59114 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcif1P59114 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcif1P59114 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcif1P59114 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcif1P59114 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcif1P59114 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcif1P59114 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcif1P59114 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcif1P59114 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcif1P59114 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcif1P59114 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcif1P59114 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcif1P59114 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcif1P59114 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcif1P59114 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcif1P59114 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcif1P59114 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcif1P59114 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcif1P59114 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcif1P59114 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcif1P59114 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcif1P59114 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcif1P59114 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcif1P59114 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcif1P59114 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcif1P59114 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcif1P59114 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcif1P59114 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcif1P59114 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcif1P59114 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcif1P59114 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcif1P59114 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcif1P59114 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcif1P59114 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcif1P59114 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcif1P59114 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcif1P59114 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcif1P59114 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcif1P59114 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcif1P59114 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcif1P59114 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcif1P59114 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcif1P59114 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcif1P59114 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcif1P59114 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcif1P59114 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcif1P59114 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcif1P59114 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcif1P59114 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcif1P59114 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcif1P59114 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcif1P59114 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcif1P59114 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcif1P59114 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcif1P59114 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcif1P59114 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms