Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Aqp4P55088 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Aqp4P55088 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Aqp4P55088 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Aqp4P55088 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Aqp4P55088 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Aqp4P55088 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Aqp4P55088 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Aqp4P55088 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Aqp4P55088 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Aqp4P55088 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Aqp4P55088 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Aqp4P55088 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Aqp4P55088 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Aqp4P55088 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Aqp4P55088 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Aqp4P55088 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Aqp4P55088 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Aqp4P55088 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Aqp4P55088 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Aqp4P55088 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Aqp4P55088 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Aqp4P55088 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Aqp4P55088 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Aqp4P55088 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Aqp4P55088 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Aqp4P55088 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Aqp4P55088 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Aqp4P55088 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Aqp4P55088 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Aqp4P55088 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Aqp4P55088 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Aqp4P55088 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Aqp4P55088 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Aqp4P55088 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Aqp4P55088 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Aqp4P55088 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Aqp4P55088 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Aqp4P55088 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Aqp4P55088 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Aqp4P55088 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Aqp4P55088 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Aqp4P55088 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Aqp4P55088 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Aqp4P55088 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Aqp4P55088 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Aqp4P55088 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Aqp4P55088 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Aqp4P55088 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Aqp4P55088 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Aqp4P55088 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Aqp4P55088 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Aqp4P55088 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Aqp4P55088 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Aqp4P55088 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Aqp4P55088 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Aqp4P55088 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Aqp4P55088 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Aqp4P55088 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Aqp4P55088 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Aqp4P55088 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Aqp4P55088 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Aqp4P55088 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Aqp4P55088 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Aqp4P55088 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Aqp4P55088 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Aqp4P55088 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Aqp4P55088 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Aqp4P55088 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Aqp4P55088 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Aqp4P55088 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Aqp4P55088 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Aqp4P55088 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Aqp4P55088 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Aqp4P55088 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Aqp4P55088 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Aqp4P55088 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Aqp4P55088 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Aqp4P55088 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Aqp4P55088 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Aqp4P55088 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Aqp4P55088 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Aqp4P55088 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Aqp4P55088 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Aqp4P55088 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Aqp4P55088 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Aqp4P55088 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Aqp4P55088 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Aqp4P55088 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Aqp4P55088 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Aqp4P55088 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Aqp4P55088 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Aqp4P55088 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Aqp4P55088 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Aqp4P55088 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Aqp4P55088 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Aqp4P55088 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Aqp4P55088 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Aqp4P55088 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Aqp4P55088 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms