Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NcanP55066 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NcanP55066 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NcanP55066 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NcanP55066 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NcanP55066 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NcanP55066 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NcanP55066 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NcanP55066 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NcanP55066 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NcanP55066 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NcanP55066 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NcanP55066 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NcanP55066 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NcanP55066 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NcanP55066 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NcanP55066 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NcanP55066 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NcanP55066 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NcanP55066 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NcanP55066 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NcanP55066 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NcanP55066 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NcanP55066 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NcanP55066 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NcanP55066 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NcanP55066 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NcanP55066 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NcanP55066 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NcanP55066 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NcanP55066 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NcanP55066 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NcanP55066 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NcanP55066 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NcanP55066 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NcanP55066 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NcanP55066 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NcanP55066 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NcanP55066 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NcanP55066 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NcanP55066 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NcanP55066 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NcanP55066 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NcanP55066 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NcanP55066 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NcanP55066 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NcanP55066 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NcanP55066 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NcanP55066 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NcanP55066 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NcanP55066 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NcanP55066 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NcanP55066 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NcanP55066 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NcanP55066 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NcanP55066 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NcanP55066 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NcanP55066 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NcanP55066 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NcanP55066 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NcanP55066 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NcanP55066 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NcanP55066 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NcanP55066 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NcanP55066 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NcanP55066 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NcanP55066 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NcanP55066 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NcanP55066 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NcanP55066 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NcanP55066 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NcanP55066 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NcanP55066 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NcanP55066 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NcanP55066 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NcanP55066 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NcanP55066 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NcanP55066 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NcanP55066 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NcanP55066 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NcanP55066 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NcanP55066 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NcanP55066 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NcanP55066 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NcanP55066 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NcanP55066 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NcanP55066 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NcanP55066 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NcanP55066 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NcanP55066 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NcanP55066 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NcanP55066 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NcanP55066 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NcanP55066 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NcanP55066 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NcanP55066 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NcanP55066 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NcanP55066 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NcanP55066 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NcanP55066 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms