Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPC3P51654 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPC3P51654 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPC3P51654 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPC3P51654 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPC3P51654 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPC3P51654 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPC3P51654 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPC3P51654 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPC3P51654 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPC3P51654 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPC3P51654 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPC3P51654 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPC3P51654 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPC3P51654 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPC3P51654 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPC3P51654 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPC3P51654 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPC3P51654 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPC3P51654 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPC3P51654 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPC3P51654 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPC3P51654 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPC3P51654 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPC3P51654 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPC3P51654 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPC3P51654 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPC3P51654 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPC3P51654 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPC3P51654 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPC3P51654 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPC3P51654 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPC3P51654 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPC3P51654 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPC3P51654 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPC3P51654 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPC3P51654 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPC3P51654 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPC3P51654 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPC3P51654 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPC3P51654 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPC3P51654 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GPC3P51654 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GPC3P51654 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GPC3P51654 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GPC3P51654 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GPC3P51654 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GPC3P51654 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GPC3P51654 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GPC3P51654 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPC3P51654 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPC3P51654 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GPC3P51654 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPC3P51654 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPC3P51654 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPC3P51654 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPC3P51654 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPC3P51654 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GPC3P51654 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPC3P51654 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPC3P51654 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GPC3P51654 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPC3P51654 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPC3P51654 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPC3P51654 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPC3P51654 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPC3P51654 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPC3P51654 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPC3P51654 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPC3P51654 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GPC3P51654 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPC3P51654 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPC3P51654 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPC3P51654 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPC3P51654 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPC3P51654 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPC3P51654 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPC3P51654 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPC3P51654 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPC3P51654 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPC3P51654 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPC3P51654 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPC3P51654 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPC3P51654 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPC3P51654 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GPC3P51654 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPC3P51654 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPC3P51654 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPC3P51654 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPC3P51654 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPC3P51654 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPC3P51654 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPC3P51654 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPC3P51654 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPC3P51654 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPC3P51654 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPC3P51654 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPC3P51654 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPC3P51654 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPC3P51654 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms