Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SrprbP47758 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SrprbP47758 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SrprbP47758 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SrprbP47758 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SrprbP47758 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SrprbP47758 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SrprbP47758 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SrprbP47758 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SrprbP47758 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SrprbP47758 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SrprbP47758 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SrprbP47758 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SrprbP47758 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SrprbP47758 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SrprbP47758 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SrprbP47758 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SrprbP47758 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SrprbP47758 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SrprbP47758 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SrprbP47758 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SrprbP47758 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SrprbP47758 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SrprbP47758 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SrprbP47758 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SrprbP47758 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SrprbP47758 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SrprbP47758 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SrprbP47758 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SrprbP47758 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SrprbP47758 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SrprbP47758 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SrprbP47758 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SrprbP47758 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SrprbP47758 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SrprbP47758 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SrprbP47758 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SrprbP47758 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SrprbP47758 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SrprbP47758 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SrprbP47758 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SrprbP47758 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SrprbP47758 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SrprbP47758 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SrprbP47758 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SrprbP47758 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SrprbP47758 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SrprbP47758 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SrprbP47758 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SrprbP47758 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SrprbP47758 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SrprbP47758 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SrprbP47758 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SrprbP47758 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SrprbP47758 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SrprbP47758 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SrprbP47758 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SrprbP47758 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SrprbP47758 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SrprbP47758 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SrprbP47758 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SrprbP47758 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SrprbP47758 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SrprbP47758 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SrprbP47758 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SrprbP47758 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SrprbP47758 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SrprbP47758 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SrprbP47758 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SrprbP47758 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SrprbP47758 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SrprbP47758 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SrprbP47758 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
SrprbP47758 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SrprbP47758 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SrprbP47758 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SrprbP47758 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SrprbP47758 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SrprbP47758 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SrprbP47758 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SrprbP47758 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SrprbP47758 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SrprbP47758 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SrprbP47758 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SrprbP47758 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SrprbP47758 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SrprbP47758 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SrprbP47758 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SrprbP47758 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SrprbP47758 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SrprbP47758 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SrprbP47758 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SrprbP47758 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SrprbP47758 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SrprbP47758 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SrprbP47758 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SrprbP47758 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SrprbP47758 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SrprbP47758 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SrprbP47758 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms