Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms