Protein–RNA interactions for Protein: P43407

Sdc2, Syndecan-2, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc2P43407 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sdc2P43407 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sdc2P43407 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Sdc2P43407 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sdc2P43407 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Sdc2P43407 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sdc2P43407 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sdc2P43407 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sdc2P43407 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sdc2P43407 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Sdc2P43407 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sdc2P43407 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sdc2P43407 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sdc2P43407 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sdc2P43407 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sdc2P43407 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sdc2P43407 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sdc2P43407 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sdc2P43407 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sdc2P43407 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sdc2P43407 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sdc2P43407 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sdc2P43407 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sdc2P43407 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sdc2P43407 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sdc2P43407 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sdc2P43407 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sdc2P43407 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sdc2P43407 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sdc2P43407 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sdc2P43407 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sdc2P43407 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sdc2P43407 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sdc2P43407 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sdc2P43407 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sdc2P43407 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sdc2P43407 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Sdc2P43407 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sdc2P43407 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Sdc2P43407 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sdc2P43407 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sdc2P43407 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sdc2P43407 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sdc2P43407 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Sdc2P43407 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sdc2P43407 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sdc2P43407 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sdc2P43407 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sdc2P43407 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sdc2P43407 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sdc2P43407 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sdc2P43407 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sdc2P43407 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sdc2P43407 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sdc2P43407 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sdc2P43407 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sdc2P43407 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sdc2P43407 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sdc2P43407 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sdc2P43407 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sdc2P43407 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sdc2P43407 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sdc2P43407 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sdc2P43407 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sdc2P43407 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sdc2P43407 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sdc2P43407 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sdc2P43407 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sdc2P43407 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sdc2P43407 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sdc2P43407 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sdc2P43407 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sdc2P43407 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sdc2P43407 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sdc2P43407 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sdc2P43407 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sdc2P43407 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sdc2P43407 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sdc2P43407 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sdc2P43407 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sdc2P43407 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sdc2P43407 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sdc2P43407 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sdc2P43407 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sdc2P43407 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sdc2P43407 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sdc2P43407 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sdc2P43407 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sdc2P43407 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sdc2P43407 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sdc2P43407 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sdc2P43407 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sdc2P43407 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sdc2P43407 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sdc2P43407 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sdc2P43407 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sdc2P43407 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Sdc2P43407 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sdc2P43407 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sdc2P43407 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms