Protein–RNA interactions for Protein: P38575

Upk2, Uroplakin-2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk2P38575 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Upk2P38575 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Upk2P38575 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Upk2P38575 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Upk2P38575 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Upk2P38575 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Upk2P38575 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Upk2P38575 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Upk2P38575 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Upk2P38575 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Upk2P38575 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Upk2P38575 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Upk2P38575 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Upk2P38575 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Upk2P38575 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Upk2P38575 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Upk2P38575 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Upk2P38575 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Upk2P38575 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Upk2P38575 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Upk2P38575 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Upk2P38575 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Upk2P38575 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Upk2P38575 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Upk2P38575 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Upk2P38575 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Upk2P38575 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Upk2P38575 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Upk2P38575 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Upk2P38575 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Upk2P38575 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Upk2P38575 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Upk2P38575 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Upk2P38575 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Upk2P38575 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Upk2P38575 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Upk2P38575 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Upk2P38575 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Upk2P38575 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Upk2P38575 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Upk2P38575 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Upk2P38575 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Upk2P38575 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Upk2P38575 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Upk2P38575 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Upk2P38575 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Upk2P38575 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Upk2P38575 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Upk2P38575 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Upk2P38575 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Upk2P38575 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Upk2P38575 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Upk2P38575 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Upk2P38575 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Upk2P38575 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Upk2P38575 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Upk2P38575 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Upk2P38575 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Upk2P38575 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Upk2P38575 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Upk2P38575 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Upk2P38575 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Upk2P38575 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Upk2P38575 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Upk2P38575 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Upk2P38575 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Upk2P38575 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Upk2P38575 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Upk2P38575 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Upk2P38575 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Upk2P38575 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Upk2P38575 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Upk2P38575 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Upk2P38575 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Upk2P38575 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Upk2P38575 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Upk2P38575 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Upk2P38575 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Upk2P38575 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Upk2P38575 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Upk2P38575 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Upk2P38575 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Upk2P38575 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Upk2P38575 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Upk2P38575 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Upk2P38575 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Upk2P38575 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Upk2P38575 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Upk2P38575 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Upk2P38575 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Upk2P38575 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Upk2P38575 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Upk2P38575 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Upk2P38575 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Upk2P38575 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Upk2P38575 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Upk2P38575 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Upk2P38575 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Upk2P38575 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Upk2P38575 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms